/media/jstevens/data/jstevens/OneDrive/active_sync/teach/psyc_971--data_science_visualization_in_r/dpavir_2023/slides
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└── custom.scssWorkflows
Jeff Stevens
2023-01-30
Review: Mental model of coding
Mental model of file directories
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Paths
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From root directory
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Starts with drive letter or
/Windows:
C:\users\jeff\Documents\projects\dpavir_2023\R\Linux and MacOS:
/home/jeff/projects/dpavir_2023/R/
Relative paths
From current directory
-
Starts with first subdirectory name
- If in
projects/, relative path toR/isdpavir_2023/R
- If in
- Use relative paths!
- Why?
Changing directories
Change directories with cd
/home/jeff/projects/dpavir_2023/
- To move from
dpavir_2023/torsconnect/, typecd exercises/01_introduction/rsconnect/
Go backwards
Move backwards with cd ..
One set of
..for each directory going backwardsTo move from
rsconnect/to01_introduction/,
typecd ..To move from
01_introduction/tocode/,
typecd ../../code/
Let’s try it!
- Go to Files in RStudio
- Add folder named
testand a subfolder namedR. - Go to Terminal.
- Type
lsordir. - How do we go to
test/? - How do we go back?
- How do we go to
test/R/? - How do we go back up to
test/?
Mental model of file directories
Workflows
Project directory structure
Build a consistent directory structure
Why?
Consistency for you
Adapt structure to your needs or lab requirements
Consistency for the lab
Make a template directory
Working directories
Base directory for R session
-
View your working directory
- Console:
getwd() - RStudio: top of Console
![]()
- Console:
What is your working directory?
RStudio Projects
Convenient system to:
Set working directory
Open files you had open before closing RStudio
Focus on relative paths
Enable version control
Use them! Always!
RStudio Projects
- Let’s create an RStudio Project for this course
RStudio Projects
- Create an RStudio Project in the existing
test/directory
Create your typical project structure
Use the terminal to change directories in your project
Project working directories
{here}: The package that sets your working directory to the RStudio Project root directory
read_csv(here("data/a.csv"))
Mental model of file directories